公司缴纳行政处罚的罚款方式如下：
通过指定银行缴纳罚款
公司应当在收到行政处罚决定书之日起十五日内，到指定的银行缴纳罚款。银行将直接收取罚款并上缴国库。
通过电子支付系统缴纳罚款
公司还可以通过电子支付系统向行政机关指定的账户缴纳罚款。这种方式同样便捷且符合《行政处罚法》的规定。
延期或分期缴纳罚款
若公司确有经济困难，可以向行政机关申请延期或分期缴纳罚款。但需经行政机关批准，并且需要按照相关规定进行申请和审批。
当场缴纳罚款
在某些特殊情况下，如交通违章罚款，公司可以直接当场缴纳罚款。但这种情况必须要有罚款收据发放，才能完成缴纳。
建议
及时缴纳：公司应确保在收到行政处罚决定书后十五日内完成罚款缴纳，以避免产生滞纳金或其他额外费用。
选择便捷方式：推荐使用电子支付系统或银行柜台缴纳，以节省时间和精力。
咨询专业人士：若对缴纳流程或具体操作有疑问，建议咨询专业律师或财务顾问，以确保合规操作。